내산서원은 인조 13년(1635)에 용계사라는 이름을 사액받고, 숙종 28년(1702)에 중수하였다. 이곳은 임진왜란 때 일본으로 잡혀가서도 조선 선비의 기질을 굽히지 않고 그곳에서 주자학의 새 물결을 일으킨 수은 강항 선생을 추모하는 서원이다.
서원철폐령으로 훼철되었다가 1974년 전라남도 영광군 불갑면 쌍운리 현재의 위치로 옮겨 다시 세워졌다. 최근 들어 임진왜란 400주년 재조명사업의 일환으로 1992년부터 연차적으로 유적지 정비사업을 하였다. 주변의 산기슭에는 강씨 문중의 무덤이 여러 개 있으며, 서원 뒤쪽으로 돌아 산을 올라가면 강항과 두 아내의 무덤이 있다.
강항은 강희맹의 5대손으로 형조좌랑에 이르렀다. 정유재란 때 군량 수송과 의병 모집 책임을 맡았다. 왜의 수군이 한산도를 쳐들어 왔을 때 포로가 되어 일본으로 끌려가 2년여의 포로생활 동안 일본에 주작학을 전하였다. 선조 33년(1600) 유배에서 풀려 귀국하였으나 적국에 잡혔던 죄인이라 하여 조정에 부름을 거부하고 은거하며 학문에 힘썼다.